Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm28048F7BCN0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm28048F7BCN0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm28048F7BCN0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm28048F7BCN0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm28048F7BCN0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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