Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17555F6U8B9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17555F6U8B9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms