Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
A430078G23RikE9Q7Y4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
A430078G23RikE9Q7Y4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms