Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc85cE9Q6B2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc85cE9Q6B2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms