Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3250E9Q1M3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3250E9Q1M3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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