Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Srp54bE9PXC0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Srp54bE9PXC0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms