Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb3D3Z6J4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms