Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms