Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa28D3Z1V9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms