Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scml2B1AVB3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms