Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm3173A6NAS3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms