Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp1bA1Z198 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms