Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms