Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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