Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Fam20bQ8VCS3 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms