Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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