Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrgP28705 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms