Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms