Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Vps8-201ENSMUST00000096191 4952 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Gm2136-201ENSMUST00000193945 2577 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sox12Q04890 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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