Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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Cntn3Q07409 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Cntn3Q07409 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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