Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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Zbtb40Q6PCS8 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Zbtb40Q6PCS8 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Zbtb40Q6PCS8 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Zbtb40Q6PCS8 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Zbtb40Q6PCS8 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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