Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ctdnep1Q3TP92 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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