Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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