Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Rpusd2Q149F1 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms