Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer3W4VSP1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms