Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cldn15Q9Z0S5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn15Q9Z0S5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn15Q9Z0S5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn15Q9Z0S5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cldn15Q9Z0S5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn15Q9Z0S5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn15Q9Z0S5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn15Q9Z0S5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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