Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin2Q9WVE8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin2Q9WVE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms