Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms