Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms