Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh2d3cQ9QZS8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms