Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt3Q9QZ47 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms