Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms