Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rcan3Q9JKK0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms