Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl39Q9JKF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms