Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rcl1Q9JJT0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rcl1Q9JJT0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rcl1Q9JJT0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms