Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc12a4Q9JIS8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc12a4Q9JIS8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc12a4Q9JIS8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc12a4Q9JIS8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms