Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr61Q9ERF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr61Q9ERF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr61Q9ERF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr61Q9ERF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms