Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MesdQ9ERE7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MesdQ9ERE7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms