Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slco1c1Q9ERB5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slco1c1Q9ERB5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms