Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dap3Q9ER88 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dap3Q9ER88 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms