Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan4Q9DCK3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms