Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Swt1Q9DBQ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Swt1Q9DBQ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms