Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhobtb1Q9DAK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms