Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmco5aQ9D9D5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmco5aQ9D9D5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms