Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arpc5lQ9D898 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arpc5lQ9D898 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms