Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af1Q9D883 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms