Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shisa5Q9D7I0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms