Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nop56Q9D6Z1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms