Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc52a3Q9D6X5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc52a3Q9D6X5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms