Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933425L06RikQ9D3Z8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms